MOE-Fellowship: Linda Labecka

WAFL: Improved detection of antibiotic resistance spread in wastewater and river microbiomes via fractionation-based long-read metagenomics

Improved detection of antibiotic resistance spread in wastewater and river microbiomes via fractionation-based short-read metagenomics

Insgesamt wurden 36 Proben aus klinischem und kommunalem Abwasser (Köln und Bonn), aus Abwasser eines Geflügelschlachthofs (Niedersachsen) sowie aus Oberflächenwasser des Rheins (Bonn) entnommen. Um die Verbreitung von Antibiotikaresistenzgenen besser nachweisen und untersuchen zu können, wurde eine fraktionierungsbasierte Extraktionsmethode verwendet, bei der extrazelluläre, intrazelluläre bakterielle DNS sowie Phagen-DNS extrahiert wurden. Insgesamt wurden 67 Proben mithilfe der Kurzlese-Metagenom-Sequenzierungstechnik (Illumina) sequenziert.

AZ: 30025/017

Zeitraum

05.02.2025 - 04.02.2026

Land

Baltikum

Institut

Research Center One Health Ruhr University Alliance Ruhr

Betreuer

Prof. Dr. Alexander Probst