Anwendung von Umwelt-DNA<\/p>\n
Die Identifizierung von aquatischen Organismen des Makrozoobenthos \u00fcber molekulare Methoden ist eine attraktive Alternative zu der morphologischen Bestimmung dieser Organismen, welche bisher weitreichend angewandt wurde. Die identifizierten Arten k\u00f6nnen dabei Auskunft \u00fcber den \u00f6kologischen Zustand eines Gew\u00e4ssers und eventuell n\u00f6tige Renaturierungsma\u00dfnahmen geben. F\u00fcr die Erfassung der Diversit\u00e4t in Flie\u00dfgew\u00e4ssern werden derzeit zwei molekulare Methoden entwickelt und angewandt. Zum einen kann genetisches Material (freie DNA) der Organismengruppen \u00fcber eine Wasserprobe gefiltert und dann von dem Filter extrahiert werden (Umwelt-DNA \u0096 eDNA). \u00dcber verschiedene Laborschritte und den Abgleich mit einer Referenzdatenbank kanndann Artenzusammensetzungen bestimmt werden. Eine weitere Methode zur Erfassung der Diversit\u00e4t ist DNA Metabarcoding. Diese unterscheidet sich zu der Erfassung \u00fcber eDNA darin, dass keine Wasserproben gefiltert werden, sondern ganze Organismen \u00fcber eine bestimmte Sammelmethode dem Gew\u00e4sser entnommen werden. <\/span><\/span><\/p>\n Im Rahmen einer Doktorarbeit und des Projektes GBOL II (German Barcode of Life) werden drei verschiedene Flu?systeme beprobt (Sieg, Ennepe, Emscher). Genommene Proben werden \u00fcber die Methoden Metabarcoding und eDNA ausgewertet. Hierbei sollen Teile der Methoden verbessert werden um ein standardisiertes Protokoll zu verfassen. Zum anderen sollen die Auswirkungen verschiedener Stressoren (Mischsysteme, Kl\u00e4ranlagen, st\u00e4dt. Einleitungen) auf die Artenzusammensetzung des Makrozoobenthos ermittelt werden.<\/span><\/span><\/p>\n Im Fr\u00fchjahr 2017 konnte ich an der Beprobung zweier Gew\u00e4sser mitwirken und Einblicke in den Beprobungsablauf bekommen. Au\u00dferdem konnte ich gesammelte Proben mit den oben genannten Methoden im Labor bearbeiten um diese auch f\u00fcr zuk\u00fcnftige Projekte anwenden zu k\u00f6nnen. <\/span><\/span><\/p>\n Der methodische Ansatz, den wir in unserer Studie verwenden, nutzt neu entwickelte Sequenzierungsmethoden (NGS = next generation sequencer) und ist eine Form des \u0084barcoding\u0093. Mit diesem Ansatz, k\u00f6nnen wir die DNA verschiedener Arten in den Wasserproben erkennen.<\/span><\/span><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":" Anwendung von Umwelt-DNA Die Identifizierung von aquatischen Organismen des Makrozoobenthos \u00fcber molekulare Methoden ist eine attraktive Alternative zu der morphologischen Bestimmung dieser Organismen, welche bisher weitreichend angewandt wurde. Die identifizierten Arten k\u00f6nnen dabei Auskunft \u00fcber den \u00f6kologischen Zustand eines Gew\u00e4ssers und eventuell n\u00f6tige Renaturierungsma\u00dfnahmen geben. F\u00fcr die Erfassung der Diversit\u00e4t in Flie\u00dfgew\u00e4ssern werden derzeit zwei […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"template":"","meta":{"footnotes":""},"categories":[],"tags":[2473],"class_list":["post-46882","moe-fellowship","type-moe-fellowship","status-publish","hentry","tag-tschechien-und-slowakei"],"meta_box":{"dbu_stipendiaten_az":"30017\/713","dbu_stipendiaten_anrede":"","dbu_stipendiaten_nachname":"Siposova","dbu_stipendiaten_vorname":"Darina","dbu_stipendiaten_titel":"","dbu_stipendiaten_fbeginn":"2017-02-07 00:00:00","dbu_stipendiaten_fende":"2017-08-06 00:00:00","dbu_stipendiaten_e_anschrif":"Universit\u00e4t Duisburg-Essen Fakult\u00e4t f\u00fcr Biologie Aquatische \u00d6kosystemforschung","dbu_stipendiaten_betreuer":"Prof. Dr. Florian Leese","dbu_stipendiaten_email_dienst":"darina.siposova@savba.sk"},"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/moe-fellowship\/46882","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/moe-fellowship"}],"about":[{"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/types\/moe-fellowship"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/moe-fellowship\/46882\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":60595,"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/moe-fellowship\/46882\/revisions\/60595"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=46882"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=46882"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/www.dbu.de\/en\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=46882"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}