Eine einseitig auf Intensivierung ausgerichtete Modernisierung der Landwirtschaft bringt gravierende Folgen für die Umwelt mit sich: Belastungen der Gewässer und des Bodens mit Nährstoffen und Pestizidrückständen und der Artenrückgang in den Agrarlandschaften sind Beispiele dafür.

Neben der Produktion von Nahrungsmitteln und natürlichen Rohstoffen kommen auf die Landwirtschaft heute wichtige ökologische Herausforderungen zu: Sie soll für den Schutz der Ressourcen sorgen, Lebensräume für Flora und Fauna bieten und Rohstoffe- und Energie erzeugen.

Förderfähig im Sinne einer mulitfufnktionalen Landnutzung sind beispielsweise Projekte, die umweltschädliche Emissionen in Grundwasser, Oberflächengewässer und Luft sowie in den Boden vermindern und vermeiden, neue Pflanzenschutzverfahren erproben oder die Sortenresistenz gegenüber Schaderregern verbessern. Außerdem wird die Nutzung standortgerecht angebauter nachwachsender Rohstoffe aus der mit dem Ziel unterstützt, marktfähige Produkte zu entwickeln und neue Einsatzmöglichkeiten zu eröffnen.